A Label Studio közvetlenül a DICOM-fájlok annotálását teszi lehetővé

A konverzió fontos információkat hagyhat el

A HumanSignal szeptember 30-án közzétett bejegyzése szerint az orvosi képalkotási adatok annotálásakor sok csapat először PNG-fájlokká alakítja a DICOM-tanulmányokat. Ezzel azonban elveszhetnek a technikus által beállított ablakolási tartományok, a fájlban már kódolt struktúrák, a szeleteket egymáshoz kapcsoló geometria és a felvétel metaadatai.

A Label Studio új felülete magát a DICOM-fájlt olvassa és abból állítja elő a vizsgálatot. Egyszerre jelenít meg egy frontális és egy oldalirányú rekonstrukciót. A térfogaton egy csúszkával lehet végighaladni, miközben a két nézet ugyanazt a pozíciót követi. A felhasználó nagyíthat, pásztázhat, illetve visszaállíthatja a nézetet az alapállapotba.

A HumanSignal szerint így az annotátor láthatja, hol helyezkedik el egy szelet a térfogaton belül, és mi található fölötte vagy alatta. A cég példája szerint az arcfelszíntől a lágyszöveteken át a csontokig lehet haladni.

Az ablakolás és a meglévő struktúrák is megmaradnak

A rendszerben az ablakolás külön vezérlőként használható. Ugyanazok a képpontadatok eltérő anatómiát mutathatnak attól függően, milyen szürkeárnyalati tartományt rendelnek hozzájuk. A felhasználó választhatja a DICOM-fejléc alapértelmezett tartományait, a fájl teljes, szűretlen tartományát, valamint csont- és lágyszöveti előbeállításokat. A felület egy fogászati nézetet is kínál, amely a fogakat emeli ki.

A beállítások váltása a HumanSignal leírása szerint egy kattintással elvégezhető, és nem módosítja a lemezen tárolt adatokat, mivel megjelenítési döntésről van szó. Ez lehetővé teszi, hogy az annotátor több ablakolási beállítással vizsgálja meg ugyanazt a területet.

Sok DICOM-fájl címkézett struktúrákat is tartalmaz. A Label Studio ezeket kiolvassa, így a kódolt struktúrák minden szelethez szegmentálva érkeznek. Az annotátor ecsettel és radírral módosíthatja a maszkot, az átfedés erősségét szabályozó vezérlővel pedig ellenőrizheti a címke határát a nyers képpontokhoz képest.

3D-nézet, szeletek és DICOM-fejléc egy felületen

A felület WebGL segítségével a teljes térfogatot 3D-ben is megjeleníti. A 3D- és a szeletnézet közös állapotot használ: ha a felhasználó egy struktúrát kiválaszt a 3D-megjelenítésben, majd visszatér a szeletnézethez, ugyanaz a struktúra marad kijelölve a térfogat megfelelő pozíciójában. A HumanSignal ezt azzal indokolja, hogy az annotátor így 3D-ben megtalálhatja a célterületet, majd 2D-ben közvetlenül oda léphet.

A DICOM-fejléc adatai egy oldalsávban jelennek meg a vizsgálat mellett. Itt láthatók többek között a felvételi paraméterek, a térköz, a tájolás, a berendezés adatai és az eredeti szerző által beállított tartományok. A cég szerint ezek akkor lehetnek különösen hasznosak, amikor egy vizsgálat méretaránya, tájolása vagy a köteg többi eleméhez viszonyított állapota nem megfelelőnek tűnik.

A felület a Label Studio Enterprise-ra épül

A HumanSignal szerint a DICOM közvetlen olvasása lehetővé teszi, hogy az annotátorok a szakterületükön használt nézetekben dolgozzanak, a fájlban már meglévő struktúrákból induljanak ki, és a kérdéses eseteket a metaadatok alapján ellenőrizzék. A cég ezt úgy írja le, hogy a csapatoknak kevesebb időt kell a kontextus újjáépítésére fordítaniuk.

A beállítások, az ablakolási előbeállítások, az eszközkészlet, az elrendezés és a szerkeszthető struktúrák mind kódolhatók. A felület a Label Studio Enterprise programozható interfészeire épül, ezért a HumanSignal szerint az adott képalkotási módszerhez és munkafolyamathoz igazítható.